Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
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CNGB1Q14028 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
CNGB1Q14028 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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