Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AF067845.4-201ENST00000633198 480 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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TOP3AQ13472 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SMR3B-204ENST00000614072 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
TOP3AQ13472 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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