Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ITGB3BPQ13352 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms