Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PCNPP2-201ENST00000441651 455 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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