Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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