Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
ERVV-2B6SEH9 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms