Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms