Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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C17orf47Q8NEP4 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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C17orf47Q8NEP4 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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C17orf47Q8NEP4 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
C17orf47Q8NEP4 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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