Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CLIP4Q8N3C7 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms