Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 BMS1P13-201ENST00000417301 885 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC004870.2-201ENST00000445615 831 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RSF1-IT2-201ENST00000529656 566 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
IMPG1Q17R60 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms