Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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