Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC024085.1-201ENST00000604299 432 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 POT1-202ENST00000393329 3950 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 PDE8B-208ENST00000505283 3474 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 KYNU-203ENST00000409512 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TRAV38-1-201ENST00000390464 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC009362.1-201ENST00000427253 406 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SL456P-201ENST00000469290 295 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 RPL7L1P7-201ENST00000509986 724 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC021979.2-201ENST00000553644 209 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC087721.1-201ENST00000559959 476 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CYP3A5-201ENST00000222982 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
FXNQ16595 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
FXNQ16595 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms