Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC015911.2-201ENST00000585536 396 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 WDR11-AS1-204ENST00000608667 522 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC064874.1-201ENST00000409661 441 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC114498.1-201ENST00000423796 607 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GRM7-AS2-201ENST00000427748 520 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 KRT18P53-201ENST00000431919 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC091096.2-201ENST00000523284 587 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
VAMP3Q15836 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.7 ms