Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ANKFY1-201ENST00000341657 7418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NRXN3-201ENST00000281127 8504 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 BAZ2A-201ENST00000379441 8831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CTNND1-202ENST00000361332 6295 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MYO15A-217ENST00000615845 11860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP2B2-201ENST00000352432 8593 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 MYO15A-201ENST00000205890 11863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PDPR-201ENST00000288050 9255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SCN5A-205ENST00000423572 8362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
HERC1Q15751 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms