Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CACNA1SQ13698 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ZMYND11-202ENST00000381584 2709 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CACNA1SQ13698 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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