Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
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TCOF1Q13428 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
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TCOF1Q13428 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
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