Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RECQLP46063 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms