Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 AC007204.1-201ENST00000621794 555 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
CASQ1P31415 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms