Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC024267.2-201ENST00000582737 417 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
UBXN4Q92575 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF566-202ENST00000424129 2644 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC010634.1-201ENST00000513925 540 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TPRXL-210ENST00000532753 478 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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UBXN4Q92575 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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UBXN4Q92575 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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UBXN4Q92575 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SAMD12-AS1-201ENST00000625758 718 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
UBXN4Q92575 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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