Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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PDK4Q16654 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PDK4Q16654 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
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