Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC097505.1-201ENST00000610199 565 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RPS4XP18-201ENST00000495480 763 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
SIX1Q15475 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC01620-202ENST00000372910 649 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SIX1Q15475 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms