Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC084083.1-201ENST00000526947 722 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMCO1Q147U7 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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