Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ALCAMQ13740 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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