Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
ITGA7Q13683 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms