Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
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SGCGQ13326 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
SGCGQ13326 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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