Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CLASP2-225ENST00000635664 4176 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NSA2-205ENST00000610426 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FHL1-204ENST00000370683 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 F13A1-201ENST00000264870 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC00960-202ENST00000492922 2126 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GNG12-201ENST00000370982 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC39A12-204ENST00000539911 2461 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MORF4L2-208ENST00000441076 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DAZ2-208ENST00000400493 3516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KIAA1217-201ENST00000307544 3281 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NLRP8-202ENST00000590542 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORA70.5-201ENST00000365519 135 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU1-122P-201ENST00000365538 156 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LDHAP5-201ENST00000394996 622 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC023469.1-201ENST00000409243 469 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC138207.1-201ENST00000442757 545 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FUNDC2P2-202ENST00000443452 493 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MED28P7-201ENST00000456611 530 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPL32P3-203ENST00000506593 498 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC027541.1-201ENST00000519306 485 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CARSP2-201ENST00000520688 277 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GLUD1P2-201ENST00000583339 201 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GLUD1P8-201ENST00000585063 203 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AOAH-210ENST00000617267 2398 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GALNTL5-206ENST00000431418 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 EYA3-208ENST00000540618 5885 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GUCY2GP-201ENST00000479705 3222 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZC3H11B-202ENST00000636126 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC30A8-205ENST00000519688 5242 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CPNE4-208ENST00000511604 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PBLD-204ENST00000358769 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SH3D19-203ENST00000409598 5284 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CDY1-201ENST00000306609 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CDY1B-201ENST00000306882 2321 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 COL21A1-203ENST00000370819 4094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CFAP61-205ENST00000377306 2017 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
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