Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PTPRMP28827 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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PTPRMP28827 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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