Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC015818.6-201ENST00000584274 634 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD8P13378 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC105114.1-201ENST00000624795 1862 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CACNB4-254ENST00000637514 1880 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GABRA6-207ENST00000523217 2393 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SEPT14-201ENST00000388975 3785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF559-ZNF177-202ENST00000446085 2470 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD8P13378 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ARFGEF3-201ENST00000251691 14877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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