Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN7O94888 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN7O94888 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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UBXN7O94888 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
UBXN7O94888 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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