Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ERVV-1B6SEH8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.8 ms