Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL9P15-201ENST00000491096 532 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC011853.1-201ENST00000518911 454 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SSXP3-201ENST00000442971 1300 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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