Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
TDP1Q9NUW8 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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