Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DYNLL1P1-201ENST00000595442 269 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LRRC37A12P-201ENST00000454917 1801 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CEP120-202ENST00000306481 4629 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DCX-206ENST00000496551 1320 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC008013.2-201ENST00000537555 348 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC211433.3-201ENST00000623770 375 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC011471.4-201ENST00000638271 216 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TLR1-201ENST00000308979 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ADNP-202ENST00000371602 6115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms