Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HERC6Q8IVU3 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HERC6Q8IVU3 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms