Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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RTL8BQ17RB0 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
RTL8BQ17RB0 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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