Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
SYCP1Q15431 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
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