Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 NOX4-213ENST00000531342 696 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 METTL15-211ENST00000634762 718 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 OR52E7P-201ENST00000452394 933 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAM2Q15035 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127 ms