Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
RUNX3Q13761 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms