Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC092570.3-201ENST00000420113 693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 PQLC2L-202ENST00000426338 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CUL4BQ13620 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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