Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL1Q13616 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL1Q13616 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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