Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 PLSCR5-203ENST00000492200 1058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 NPM1P35-201ENST00000533043 868 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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TCIRG1Q13488 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
TCIRG1Q13488 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
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