Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
FOXE3Q13461 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CCR8-201ENST00000326306 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DSCAM-IT1-201ENST00000440363 720 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC023421.2-202ENST00000586213 547 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC004241.2-201ENST00000614562 444 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 MCFD2-206ENST00000409800 3955 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 NCOR1-204ENST00000395851 7950 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
FOXE3Q13461 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms