Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC012594.1-252ENST00000595011 876 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HOTTIP_2.1-201ENST00000616633 376 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC078909.2-201ENST00000620584 398 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL022163.1-201ENST00000430261 1569 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SMG1P4-203ENST00000517529 1589 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC241584.2-201ENST00000637142 2090 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RBM23-203ENST00000359890 10040 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LRRC8B-203ENST00000439853 7474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS17-209ENST00000561157 1909 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MRPS31P5-201ENST00000416599 3494 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 HDAC1P1-201ENST00000455482 1445 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC087280.2-201ENST00000637205 4822 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ABLIM3-207ENST00000508983 2011 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PRIM2-207ENST00000615550 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NUFIP1-201ENST00000379161 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC053481.2-201ENST00000602493 1815 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IGLV5-52-201ENST00000390289 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 PUDPP2-201ENST00000431423 643 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC114755.4-201ENST00000439114 443 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 LIX1L-AS1-207ENST00000448561 347 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL590369.1-201ENST00000455074 470 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AL451085.1-201ENST00000604546 690 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC124319.3-201ENST00000616832 526 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC005753.1-201ENST00000623837 618 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AP001043.1-201ENST00000626259 773 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 WBP1L-201ENST00000369889 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
CLN3Q13286 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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