Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
ACADSBP45954 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms