Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LRRTM2O43300 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRTM2O43300 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRTM2O43300 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRTM2O43300 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
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LRRTM2O43300 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LRRTM2O43300 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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