Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC009220.2-201ENST00000489759 1751 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GTF2H3-201ENST00000228955 1472 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007790.1-201ENST00000439081 782 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL350P-201ENST00000492591 299 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RN7SL776P-201ENST00000493390 268 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR378H-201ENST00000579966 83 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 EXOSC3P2-201ENST00000594464 497 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS4XP16-202ENST00000595905 807 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 SNORA55-201ENST00000364587 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
VAMP3Q15836 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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