Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNFX1-204ENST00000396105 7371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006058.1-201ENST00000568686 5067 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RASGRF2-201ENST00000265080 8167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NBEA-207ENST00000537702 4089 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC245060.6-201ENST00000624350 8420 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NSD2-207ENST00000398261 8390 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CTNND1-220ENST00000529526 6099 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 FTX-215ENST00000638681 9771 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 SCAND2P-201ENST00000348993 8975 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 PIEZO2-203ENST00000503781 8259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HERC1Q15751 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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