Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
PUM3Q15397 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 ITGA9-AS1-203ENST00000429532 702 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL031599.1-201ENST00000432694 808 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.5 ms