Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SNORA51.9-201ENST00000384295 124 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MYL12BP2-201ENST00000503948 512 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL671883.2-201ENST00000539514 536 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL589935.1-201ENST00000602418 488 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms