Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC005229.3-201ENST00000603438 323 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
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ITGA9Q13797 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AL355112.1-201ENST00000550309 1236 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ITGA9Q13797 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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